Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CBFBQ13951 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms