Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CUL4BQ13620 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CUL4BQ13620 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms