Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms