Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AP3B2Q13367 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms