Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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