Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
DUSP4Q13115 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
DUSP4Q13115 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms