Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms