Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BNIP1Q12981 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms