Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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