Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
FOXO1Q12778 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
FOXO1Q12778 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms