Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SREBF2Q12772 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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