Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ABCC8Q09428 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ABCC8Q09428 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms