Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SLFN5Q08AF3 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SLFN5Q08AF3 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms