Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SOX4Q06945 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms