Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PTPN11Q06124 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms