Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
UBE3AQ05086 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms