Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ACVR1Q04771 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms