Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PLCB3Q01970 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PLCB3Q01970 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms