Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
IRF9Q00978 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms