Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
TFAMQ00059 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms