Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HERVK_113P63132 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113P63132 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms