Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 RNF43-201ENST00000407977 5516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ATG7-201ENST00000354449 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
HERVK_113P61574 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms