Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP54P61011 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP54P61011 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP54P61011 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP54P61011 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SRP54P61011 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms