Protein–RNA interactions for Protein: P55789

GFER, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFERP55789 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFERP55789 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFERP55789 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFERP55789 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFERP55789 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFERP55789 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFERP55789 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFERP55789 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFERP55789 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFERP55789 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms