Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ME1P48163 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ME1P48163 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
ME1P48163 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ME1P48163 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ME1P48163 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
ME1P48163 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ME1P48163 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ME1P48163 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ME1P48163 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms