Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PHF5A-201ENST00000216252 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ATRXP46100 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ATRXP46100 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ATRXP46100 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ATRXP46100 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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