Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RANGAP1P46060 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms