Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ACADSBP45954 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms