Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TSFMP43897 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TSFMP43897 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TSFMP43897 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms