Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRIM23P36406 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms