Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GJC1P36383 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GJC1P36383 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GJC1P36383 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms