Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGER1P34995 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PTGER1P34995 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms