Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LMO2P25791 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LMO2P25791 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
LMO2P25791 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
LMO2P25791 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LMO2P25791 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LMO2P25791 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms