Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ITGB6P18564 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ITGB6P18564 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms