Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LINC00437-201ENST00000414161 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
HOXB4P17483 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
HOXB4P17483 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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