Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 AP001830.1-201ENST00000528717 692 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC008567.2-201ENST00000589751 656 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC090953.1-201ENST00000604305 1092 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HOXB3P14651 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms