Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ITGA4P13612 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ITGA4P13612 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms