Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CDH1P12830 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms