Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC192P0DO97 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC192P0DO97 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms