Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
RHOP08100 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
RHOP08100 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHOP08100 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
RHOP08100 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RHOP08100 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RHOP08100 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RHOP08100 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms