Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SPTA1P02549 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SPTA1P02549 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SPTA1P02549 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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