Protein–RNA interactions for Protein: O75335

PPFIA4, Liprin-alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA4O75335 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PPFIA4O75335 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms