Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CEP104O60308 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CEP104O60308 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms