Protein–RNA interactions for Protein: O43347

MSI1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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MSI1O43347 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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MSI1O43347 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
MSI1O43347 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MSI1O43347 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
MSI1O43347 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
MSI1O43347 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSI1O43347 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSI1O43347 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSI1O43347 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
MSI1O43347 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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