Protein–RNA interactions for Protein: O00421

CCRL2, C-C chemokine receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCRL2O00421 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CCRL2O00421 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CCRL2O00421 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms