Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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