Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ERVV-2B6SEH9 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms