Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HMGB1P1B2RPK0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms