Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
STRCP1A6NGW2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms