Protein–RNA interactions for Protein: A2VEC9

SSPO, SCO-spondin, humanhuman

Predictions only

Length 5,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPOA2VEC9 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MYOZ3-209ENST00000615557 1031 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CUTA-215ENST00000611509 1199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC114812.1-201ENST00000421868 689 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
SSPOA2VEC9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
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